神经外科是我院的专科临床科室，其首例颅脑血肿清除术于1970年在当时衢县第一人民医院医师协助下完成。1984年始正式开始神经外科手术，1993年从骨科分出，成为独立的临床科室。
目前神经外科有副主任一名，主治医师二名，住院医师三名，护士10名。拥有双极电凝器、多功能头架、冷光源、手术显微镜、颅内压监护仪、蛇形拉勾、MEC监护仪及其它显微器械等进的手术与监护设备。建科以来，已收治颅脑外伤患者数千余名，能独立开展脑血管病（高血压脑出、AVM）、V-P分流术和各类脑外伤手术以及神经胶质瘤、脑膜瘤、听神经瘤、脑转移瘤等手术，应用亚低温疗法新技术治疗重症颅脑外伤取得较好效果。
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